jef.works

Webbplats analys jef.works

JEFworks Lab - Welcome to the JEFworks Lab

 Genereras på Maj 02 2026 01:05 AM

Gammal statistik? UPDATERA !

Ställningen är 63/100

SEO Innehåll

Titel

JEFworks Lab - Welcome to the JEFworks Lab

Längd : 42

Perfekt, din titel innehåller mellan 10 och 70 tecken.

Beskrivning

Lab website of Prof. Jean Fan and team work at Johns Hopkins University

Längd : 71

Bra, din metabeskrivning innehåller mellan 70 och 160 tecken.

Nyckelord

bioinformatics, single cell, spatial transcriptomics, spatially resolved transcriptomics, merfish, computational biology, research lab, JHU research opportunities

Bra, din sida innehåller meta-taggar.

Og Meta Egenskaper

Bra, din sida drar nytta utav Og.

Egendom Innehåll
title Welcome to the JEFworks Lab
locale en_US
description Lab website of Prof. Jean Fan and team work at Johns Hopkins University
url http://jefworks-lab.github.io//
site_name JEFworks Lab
image http://jefworks-lab.github.io//assets/banners/bg.jpg
type website

Rubriker

H1 H2 H3 H4 H5 H6
4 7 1 0 0 0
  • [H1] Welcome to the JEFworks Lab, where Prof. Jean Fan and team work on statistical analysis approaches and machine learning tools for analyzing big spatially resolved omics data to better understand the molecular and spatial-contextual factors shaping cellular identity and heterogeneity in the context of human health and disease.
  • [H1]
  • [H1]
  • [H1]
  • [H2] We are a bioinformatics research lab in the Center for Computational Biology and the Department of Biomedical Engineering at Johns Hopkins University. Meet our team!
  • [H2] We develop bioinformatics methods for analyzing spatially resolved sequencing and imaging data.
  • [H2] We apply these bioinformatics methods to better understand the role of cellular heterogeneity in disease.
  • [H2] Latest Publications
  • [H2] Latest News
  • [H2] Latest Blog Posts
  • [H2] Latest Lab Fun
  • [H3] Follow us on social media for the latest updates on our blog posts, code tutorials, software tools, and more!

Bilder

Vi hittade 39 bilder på denna webbsida.

22 alt attribut är tomma eller saknas. Lägg till alternativ text så att sökmotorer enklare kan förstå innehållet i dina bilder.

Text/HTML Ratio

Ratio : 35%

Idealisk! Den här sidans text till HTML-kod förhållande är mellan 25 och 70 procent.

Flash

Perfekt, inga Flash-innehåll har upptäckts på denna sida.

Iframe

Bra, vi upptäckte inga Iframes på den här sidan.

URL Rewrite

Bra. Dina adressfält ser bra ut!

Understreck i URLen

Vi har upptäckt understreck i din webbadress. Du bör hellre använda bindestreck för att optimera din SEO.

In-page länkar

Vi hittade totalt 33 länkar inklusive 0 länk(ar) till filer

Anchor Typ Juice
Our Mission Interna Passing Juice
Meet the Team Interna Passing Juice
Lab Resources Interna Passing Juice
Publications Interna Passing Juice
Software Interna Passing Juice
Courses Interna Passing Juice
Talks Interna Passing Juice
Join Interna Passing Juice
Contact Interna Passing Juice
Blog Interna Passing Juice
Center for Computational Biology Externa Passing Juice
Department of Biomedical Engineering Externa Passing Juice
Meet our team! Interna Passing Juice
Gohta Aihara, Kalen Clifton, Mayling Chen, Zhuoyan Li, Lyla Atta, Brendan F Miller, Rahul Satija, John W Hickey, Jean Fan^. SEraster - a rasterization preprocessing framework for scalable spatial omics data analysis. Bioinformatics. June 20, 2024. doi.org/10.1093/bioinformatics/btae412 Interna Passing Juice
Lyla Atta, Kalen Clifton, Manjari Anant, Gohta Aihara, and Jean Fan^. Gene count normalization in single-cell imaging-based spatially resolved transcriptomics. Genome Biology. June 12, 2024. doi.org/10.1186/s13059-024-03303-w Interna Passing Juice
Kalen Clifton*, Manjari Anant*, Gohta Aihara, Lyla Atta, Osagie K Aimiuwu, Justus M Kebschull, Michael I Miller, Daniel Tward^, Jean Fan^. STalign - alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping. Nature Communications. December 8, 2023. doi.org/10.1038/s41467-023-43915-7 Interna Passing Juice
Brendan F Miller, Feiyang Huang, Lyla Atta, Arpan Sahoo, Jean Fan^. Reference-free cell type deconvolution of pixel-resolution spatially resolved transcriptomics data. Nature Communications. 2022. doi:/10.1038/s41467-022-30033-z Interna Passing Juice
Lyla Atta, Jean Fan^. Computational challenges and opportunities in spatially resolved transcriptomic data analysis. Nature Communications. 2021. doi:10.1038/s41467-021-25557-9 Interna Passing Juice
Spatial Transcriptomics As Rasterized Image Tensors (STARIT) characterizes cell states with subcellular molecular heterogeneity Interna Passing Juice
STcompare - comparative spatial transcriptomics data analysis of structurally matched tissues to characterize differentially spatially patterned genes Interna Passing Juice
Impact of Data Quality on Deep Learning Prediction of Spatial Transcriptomics from Histology Images Interna Passing Juice
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes Interna Passing Juice
Evidence of off-target probe binding in the 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel compromises accuracy of spatial transcriptomic profiling Interna Passing Juice
Prof. Fan teaches first year BME PhD students about the limitations of summary statistics and the importance of visualizing your data! Interna Passing Juice
Dr. Fan and Caleb give invited talks at the Broad Institute Models, Inference, and Algorithms seminar series. Interna Passing Juice
Prof. Fan teaches Genomic Data Visualization again this semester! JEFworks Lab members give guest lectures in the Genomic Data Visualizations class. Interna Passing Juice
Vivien and Kalen presents their work at the WSE/DOM retreat. Thanks to Liz and Rafael for the photos. Interna Passing Juice
Dr. Fan gives an invited talk at the Center for Bioinformatics and Quantitative Biology at University of Illinois at Chicago. Interna Passing Juice
Vibe coding with SEraster and STcompare to compare spatial transcriptomics technologies Interna Passing Juice
RNA velocity in situ infers gene expression dynamics using spatial transcriptomics data Interna Passing Juice
Analyzing ICE Arrest Data - Part 2 Interna Passing Juice
Analyzing ICE Detention Data from 2021 to 2025 Interna Passing Juice
Creative Commons Attribution 4.0 International License Externa Passing Juice

SEO Nyckelord

Nyckelord Moln

transcriptomics jean fan data lab bioinformatics spatial heterogeneity spatially analysis

Nyckelord Konsistens

Nyckelord Innehåll Titel Nyckelord Beskrivning Rubriker
fan 15
data 14
spatial 12
jean 10
transcriptomics 9

Användbarhet

Url

Domän : jef.works

Längd : 9

Favikon

Bra, din webbplats har en favicon.

Utskriftbart

Vi kunde inte hitta CSS för utskrifter.

Språk

Du har inte angett språk. Använd denna meta-tag generator helt gratis för att ange språk på din webbplats.

Dublin Core

Denna sida drar inte nytta utav Dublin Core.

Dokument

Doctype

HTML 5

Encoding

Perfekt. Din deklarerade teckenuppsättning är UTF-8.

W3C Validity

Errors : 0

Varningar : 0

E-post Sekretess

Bra! Ingen e-postadress har hittats i klartext.

Föråldrad HTML

Föråldrade taggar Förekomster
<u> 3

Föråldrade HTML-taggar är HTML-taggar som inte längre används. Vi rekommenderar att du tar bort eller ersätter dessa eftersom dom nu är föråldrade.

Hastighets Tips

Utmärkt, din webbplats använder inga nästlade tabeller.
Synd, din webbplats använder sig utav inline stilar.
Bra, din webbplats har få CSS-filer.
Perfekt, din webbplats har få Javascript filer
Perfekt, din webbplats utnyttjar gzip.

Mobil

Mobiloptimering

Apple Ikon
Meta Viewport Tagg
Flash innehåll

Optimering

XML Sitemap

Bra, din webbplats har en XML sitemap.

http://jefworks-lab.github.io//sitemap.xml

Robots.txt

https://jef.works/robots.txt

Bra, din webbplats har en robots.txt fil.

Analytics

Bra, din webbplats har ett analysverktyg.

   Google Analytics

PageSpeed Insights

Enhet
Kategorier

Free SEO Testing Tool

Free SEO Testing Tool är en fri SEO verktyg som hjälper dig att analysera din webbplats