jef.works

Webseiten-Bericht für jef.works

JEFworks Lab - Welcome to the JEFworks Lab

 Generiert am 02 Mai 2026 01:05 AM

Aktuelle Statistiken? UPDATE !

Der Wert ist 63/100

SEO Inhalte

Seitentitel

JEFworks Lab - Welcome to the JEFworks Lab

Länge : 42

Perfekt, denn Ihr Seitentitel enthält zwischen 10 und 70 Anzahl Zeichen.

Seitenbeschreibung

Lab website of Prof. Jean Fan and team work at Johns Hopkins University

Länge : 71

Großartig, denn Ihre Seitenbeschreibung enthält zwischen 70 und 160 Anzahl Zeichen.

Suchbegriffe

bioinformatics, single cell, spatial transcriptomics, spatially resolved transcriptomics, merfish, computational biology, research lab, JHU research opportunities

Gut, denn Ihre Webseite enthält Suchbegriffe.

Og META Eigenschaften

Sehr gut, denn diese Webseite nutzt die Vorteile aus den Og Properties.

Eigenschaft Inhalt
title Welcome to the JEFworks Lab
locale en_US
description Lab website of Prof. Jean Fan and team work at Johns Hopkins University
url http://jefworks-lab.github.io//
site_name JEFworks Lab
image http://jefworks-lab.github.io//assets/banners/bg.jpg
type website

Überschriften

H1 H2 H3 H4 H5 H6
4 7 1 0 0 0
  • [H1] Welcome to the JEFworks Lab, where Prof. Jean Fan and team work on statistical analysis approaches and machine learning tools for analyzing big spatially resolved omics data to better understand the molecular and spatial-contextual factors shaping cellular identity and heterogeneity in the context of human health and disease.
  • [H1]
  • [H1]
  • [H1]
  • [H2] We are a bioinformatics research lab in the Center for Computational Biology and the Department of Biomedical Engineering at Johns Hopkins University. Meet our team!
  • [H2] We develop bioinformatics methods for analyzing spatially resolved sequencing and imaging data.
  • [H2] We apply these bioinformatics methods to better understand the role of cellular heterogeneity in disease.
  • [H2] Latest Publications
  • [H2] Latest News
  • [H2] Latest Blog Posts
  • [H2] Latest Lab Fun
  • [H3] Follow us on social media for the latest updates on our blog posts, code tutorials, software tools, and more!

Bilder

Es konnten 39 Bilder auf dieser Webseite gefunden werden.

Bei 22 Bilder(n) fehlt ein ALT-Attribut. Fügen Sie ALT-Attribute zu Ihren Bildern, um die Bedeutung der Bilder für Suchmaschinen zugänglich zu machen.

Text/HTML Verhältnis

Anteil : 35%

Ideal! Das Text zu HTML Code Verhältnis dieser Webseite ist zwischen 25 und 70 Prozent.

Flash

Perfekt, denn es wurde kein Flash auf Ihrer Webseite gefunden.

IFrame

Großartig, denn Sie verwenden keine IFrames auf Ihrer Webseite.

URL Rewrite

Gut. Ihre Links sind für Suchmaschinen gut lesbar (sprechende Links)!

Underscores in the URLs

Wir haben Unterstriche in Ihren Links entdeckt. Benutzen Sie zur Optimierung besser Bindestriche in Ihren Links.

In-page links

We found a total of 33 links including 0 link(s) to files

Anker Typ Natürlich
Our Mission intern natürliche Links
Meet the Team intern natürliche Links
Lab Resources intern natürliche Links
Publications intern natürliche Links
Software intern natürliche Links
Courses intern natürliche Links
Talks intern natürliche Links
Join intern natürliche Links
Contact intern natürliche Links
Blog intern natürliche Links
Center for Computational Biology extern natürliche Links
Department of Biomedical Engineering extern natürliche Links
Meet our team! intern natürliche Links
Gohta Aihara, Kalen Clifton, Mayling Chen, Zhuoyan Li, Lyla Atta, Brendan F Miller, Rahul Satija, John W Hickey, Jean Fan^. SEraster - a rasterization preprocessing framework for scalable spatial omics data analysis. Bioinformatics. June 20, 2024. doi.org/10.1093/bioinformatics/btae412 intern natürliche Links
Lyla Atta, Kalen Clifton, Manjari Anant, Gohta Aihara, and Jean Fan^. Gene count normalization in single-cell imaging-based spatially resolved transcriptomics. Genome Biology. June 12, 2024. doi.org/10.1186/s13059-024-03303-w intern natürliche Links
Kalen Clifton*, Manjari Anant*, Gohta Aihara, Lyla Atta, Osagie K Aimiuwu, Justus M Kebschull, Michael I Miller, Daniel Tward^, Jean Fan^. STalign - alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping. Nature Communications. December 8, 2023. doi.org/10.1038/s41467-023-43915-7 intern natürliche Links
Brendan F Miller, Feiyang Huang, Lyla Atta, Arpan Sahoo, Jean Fan^. Reference-free cell type deconvolution of pixel-resolution spatially resolved transcriptomics data. Nature Communications. 2022. doi:/10.1038/s41467-022-30033-z intern natürliche Links
Lyla Atta, Jean Fan^. Computational challenges and opportunities in spatially resolved transcriptomic data analysis. Nature Communications. 2021. doi:10.1038/s41467-021-25557-9 intern natürliche Links
Spatial Transcriptomics As Rasterized Image Tensors (STARIT) characterizes cell states with subcellular molecular heterogeneity intern natürliche Links
STcompare - comparative spatial transcriptomics data analysis of structurally matched tissues to characterize differentially spatially patterned genes intern natürliche Links
Impact of Data Quality on Deep Learning Prediction of Spatial Transcriptomics from Histology Images intern natürliche Links
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes intern natürliche Links
Evidence of off-target probe binding in the 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel compromises accuracy of spatial transcriptomic profiling intern natürliche Links
Prof. Fan teaches first year BME PhD students about the limitations of summary statistics and the importance of visualizing your data! intern natürliche Links
Dr. Fan and Caleb give invited talks at the Broad Institute Models, Inference, and Algorithms seminar series. intern natürliche Links
Prof. Fan teaches Genomic Data Visualization again this semester! JEFworks Lab members give guest lectures in the Genomic Data Visualizations class. intern natürliche Links
Vivien and Kalen presents their work at the WSE/DOM retreat. Thanks to Liz and Rafael for the photos. intern natürliche Links
Dr. Fan gives an invited talk at the Center for Bioinformatics and Quantitative Biology at University of Illinois at Chicago. intern natürliche Links
Vibe coding with SEraster and STcompare to compare spatial transcriptomics technologies intern natürliche Links
RNA velocity in situ infers gene expression dynamics using spatial transcriptomics data intern natürliche Links
Analyzing ICE Arrest Data - Part 2 intern natürliche Links
Analyzing ICE Detention Data from 2021 to 2025 intern natürliche Links
Creative Commons Attribution 4.0 International License extern natürliche Links

SEO Suchbegriffe

Suchbegriffswolke

heterogeneity fan spatially data lab spatial bioinformatics transcriptomics jean analysis

Keywords Consistency

Suchbegriff Inhalt Seitentitel Suchbegriffe Seitenbeschreibung Überschriften
fan 15
data 14
spatial 12
jean 10
transcriptomics 9

Benutzerfreundlichkeit

URL

Domain : jef.works

Länge : 9

Favoriten Icon

Gut. Die Webseite hat ein Favicon.

Druckeigenschaften

Es konnten keine druckfreundlichen CSS-Angaben gefunden werden.

Sprache

Es wurde in den META-Elementen keine Sprache deklariert. Benutzen Sie dieses kostenlose Werkzeug um ein META-Element für die Sprache zu erzeugen.

Dublin Core

Diese Webseite nutzt nicht die Vorteile der Dublin Core Elemente.

Dokument

Doctype

HTML 5

Verschlüsselung

Perfekt, denn Ihre Webseite deklariert einen Zeichensatz: UTF-8.

W3C Validität

Fehler : 0

Warnungen : 0

E-Mail Datenschutz

Sehr gut, denn es wurde keine E-Mail Adresse im Klartext auf Ihrer Webseite gefunden.

Veraltetes HTML

Veraltete Tags Vorkommen
<u> 3

Überholte (deprecated) HTML Tags sind HTML Tags, die zwar aktuell funktionieren, aber bald nicht mehr von jedem Browser unterstützt werden. Wir empfehlen Ihnen diese überholten HTML Tags durch aktuelle HTML Tags zu ersetzen.

Tipps zur Webseitengeschwindigkeit

Sehr gut, denn Ihre Webseite benutzt keine verschachtelten Tabellen.
Schlecht, denn es wurden CSS-Angaben in HTML-Elementen entdeckt. Diese Angaben sollten in ein entsprechendes CSS-Stylesheet verlagert werden.
Gut, denn Ihre Webseite enthält nur wenig CSS-Dateien.
Perfekt, denn Ihre Webseite enthät nur wenig Javascript-Dateien.
Gut! Sie nutzen die Vorteile von gzip.

Mobile

Mobile Optimierung

Apple Icon
META Viewport Tag
Flash Inhalt

Optimierung

XML-Sitemap

Perfekt! Ihre Seite hat eine XML-Sitemap.

http://jefworks-lab.github.io//sitemap.xml

Robots.txt

https://jef.works/robots.txt

Sehr gut! Ihre Webseite enthält eine robots.txt-Datei.

Analytics

Sehr gut, Ihre Website hat ein Analyse-Tool.

   Google Analytics

PageSpeed Insights


Gerät
Kategorien

Free SEO Testing Tool

Free SEO Testing Tool ist ein kostenloses SEO Werkzeug zur Analyse Ihrer Webseite