jef.works

Avaliação do site jef.works

JEFworks Lab - Welcome to the JEFworks Lab

 Gerado a 02 de Maio de 2026 01:05 AM

Estatísticas desatualizadas? ATUALIZE !

O resultado é de 63/100

Conteúdo SEO

Título

JEFworks Lab - Welcome to the JEFworks Lab

Cumprimento : 42

Perfeito, o Título contém entre 10 e 70 caracteres.

Descrição

Lab website of Prof. Jean Fan and team work at Johns Hopkins University

Cumprimento : 71

Perfeito, a Descrição META contém entre 70 e 160 caracteres.

Palavras-chave

bioinformatics, single cell, spatial transcriptomics, spatially resolved transcriptomics, merfish, computational biology, research lab, JHU research opportunities

Perfeito, a página contém palavras-chave META.

Propriedades Og Meta

Boa! Esta página tira vantagens das propriedades Og.

Propriedade Conteúdo
title Welcome to the JEFworks Lab
locale en_US
description Lab website of Prof. Jean Fan and team work at Johns Hopkins University
url http://jefworks-lab.github.io//
site_name JEFworks Lab
image http://jefworks-lab.github.io//assets/banners/bg.jpg
type website

Cabeçalhos

H1 H2 H3 H4 H5 H6
4 7 1 0 0 0
  • [H1] Welcome to the JEFworks Lab, where Prof. Jean Fan and team work on statistical analysis approaches and machine learning tools for analyzing big spatially resolved omics data to better understand the molecular and spatial-contextual factors shaping cellular identity and heterogeneity in the context of human health and disease.
  • [H1]
  • [H1]
  • [H1]
  • [H2] We are a bioinformatics research lab in the Center for Computational Biology and the Department of Biomedical Engineering at Johns Hopkins University. Meet our team!
  • [H2] We develop bioinformatics methods for analyzing spatially resolved sequencing and imaging data.
  • [H2] We apply these bioinformatics methods to better understand the role of cellular heterogeneity in disease.
  • [H2] Latest Publications
  • [H2] Latest News
  • [H2] Latest Blog Posts
  • [H2] Latest Lab Fun
  • [H3] Follow us on social media for the latest updates on our blog posts, code tutorials, software tools, and more!

Imagens

Encontrámos 39 imagens nesta página.

22 atributos ALT estão vazios ou em falta. É recomendado adicionar texto alternativo de modo a que os motores de busca identifiquem melhor o conteúdo das suas imagens.

Rácio Texto/HTML

Rácio : 35%

Ideal! O rácio de texto para código HTML desta página está entre 25 e 70 porcento.

Flash

Perfeito, não foi encontrado conteúdo Flash nesta página.

Iframe

Excelente, não foram detetadas Iframes nesta página.

Reescrita de URL

Perfeito. As ligações aparentam ser limpas!

Underscores (traços inferiores) nas URLs

Detetámos 'underscores' (traços inferiores) nas suas URLs. O uso hífens é mais eficiente em termos de otimização SEO.

Ligações para a própria página

Encontrámos um total de 33 ligações incluindo 0 ligações a ficheiros

Âncoras Tipo Sumo
Our Mission Internas Passa sumo
Meet the Team Internas Passa sumo
Lab Resources Internas Passa sumo
Publications Internas Passa sumo
Software Internas Passa sumo
Courses Internas Passa sumo
Talks Internas Passa sumo
Join Internas Passa sumo
Contact Internas Passa sumo
Blog Internas Passa sumo
Center for Computational Biology Externas Passa sumo
Department of Biomedical Engineering Externas Passa sumo
Meet our team! Internas Passa sumo
Gohta Aihara, Kalen Clifton, Mayling Chen, Zhuoyan Li, Lyla Atta, Brendan F Miller, Rahul Satija, John W Hickey, Jean Fan^. SEraster - a rasterization preprocessing framework for scalable spatial omics data analysis. Bioinformatics. June 20, 2024. doi.org/10.1093/bioinformatics/btae412 Internas Passa sumo
Lyla Atta, Kalen Clifton, Manjari Anant, Gohta Aihara, and Jean Fan^. Gene count normalization in single-cell imaging-based spatially resolved transcriptomics. Genome Biology. June 12, 2024. doi.org/10.1186/s13059-024-03303-w Internas Passa sumo
Kalen Clifton*, Manjari Anant*, Gohta Aihara, Lyla Atta, Osagie K Aimiuwu, Justus M Kebschull, Michael I Miller, Daniel Tward^, Jean Fan^. STalign - alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping. Nature Communications. December 8, 2023. doi.org/10.1038/s41467-023-43915-7 Internas Passa sumo
Brendan F Miller, Feiyang Huang, Lyla Atta, Arpan Sahoo, Jean Fan^. Reference-free cell type deconvolution of pixel-resolution spatially resolved transcriptomics data. Nature Communications. 2022. doi:/10.1038/s41467-022-30033-z Internas Passa sumo
Lyla Atta, Jean Fan^. Computational challenges and opportunities in spatially resolved transcriptomic data analysis. Nature Communications. 2021. doi:10.1038/s41467-021-25557-9 Internas Passa sumo
Spatial Transcriptomics As Rasterized Image Tensors (STARIT) characterizes cell states with subcellular molecular heterogeneity Internas Passa sumo
STcompare - comparative spatial transcriptomics data analysis of structurally matched tissues to characterize differentially spatially patterned genes Internas Passa sumo
Impact of Data Quality on Deep Learning Prediction of Spatial Transcriptomics from Histology Images Internas Passa sumo
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes Internas Passa sumo
Evidence of off-target probe binding in the 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel compromises accuracy of spatial transcriptomic profiling Internas Passa sumo
Prof. Fan teaches first year BME PhD students about the limitations of summary statistics and the importance of visualizing your data! Internas Passa sumo
Dr. Fan and Caleb give invited talks at the Broad Institute Models, Inference, and Algorithms seminar series. Internas Passa sumo
Prof. Fan teaches Genomic Data Visualization again this semester! JEFworks Lab members give guest lectures in the Genomic Data Visualizations class. Internas Passa sumo
Vivien and Kalen presents their work at the WSE/DOM retreat. Thanks to Liz and Rafael for the photos. Internas Passa sumo
Dr. Fan gives an invited talk at the Center for Bioinformatics and Quantitative Biology at University of Illinois at Chicago. Internas Passa sumo
Vibe coding with SEraster and STcompare to compare spatial transcriptomics technologies Internas Passa sumo
RNA velocity in situ infers gene expression dynamics using spatial transcriptomics data Internas Passa sumo
Analyzing ICE Arrest Data - Part 2 Internas Passa sumo
Analyzing ICE Detention Data from 2021 to 2025 Internas Passa sumo
Creative Commons Attribution 4.0 International License Externas Passa sumo

Palavras-chave SEO

Núvem de palavras-chave

bioinformatics spatial transcriptomics fan spatially lab heterogeneity jean data analysis

Consistência das Palavras-chave

Palavra-chave Conteúdo Título Palavras-chave Descrição Cabeçalhos
fan 15
data 14
spatial 12
jean 10
transcriptomics 9

Usabilidade

Url

Domínio : jef.works

Cumprimento : 9

Favicon

Ótimo, o site tem um favicon.

Facilidade de Impressão

Não encontrámos CSS apropriado para impressão.

Língua

Não foi declarada nenhuma língua para este site.

Dublin Core

Esta página não tira vantagens do Dublin Core.

Documento

Tipo de Documento

HTML 5

Codificação

Perfeito. O conjunto de caracteres UTF-8 está declarado.

Validação W3C

Erros : 0

Avisos : 0

Privacidade do Email

Boa! Nenhum endereço de email está declarado sob a forma de texto!

HTML obsoleto

Etiquetas obsoletas Ocorrências
<u> 3

Etiquetas HTML obsoletas são etiquetas que já não são usadas segundo as normas mais recentes. É recomendado que sejam removidas ou substituídas por outras etiquetas atualizadas.

Dicas de Velocidade

Excelente, este site não usa tablelas dentro de tabelas.
Oh não, o site usa estilos CSS nas etiquetas HTML.
Boa, o site usa poucos ficheiros CSS.
Perfeito, o site usa poucos ficheiros JavaScript.
Perfeito, o site tira vantagens da compressão gzip.

Dispositivos Móveis

Otimização para dispositivos móveis

Icon Apple
Meta Viewport Tag
Conteúdo Flash

Otimização

XML Sitemap

Perfeito, o site tem um mapa XML do site (sitemap).

http://jefworks-lab.github.io//sitemap.xml

Robots.txt

https://jef.works/robots.txt

Perfeito, o seu site tem um ficheiro robots.txt.

Analytics

Perfeito, o site tem uma ferramenta analítica para a análise de atividade.

   Google Analytics

PageSpeed Insights

Dispositivo
Categorias

Free SEO Testing Tool

Free SEO Testing Tool é uma ferramenta gratuita que o ajuda a avaliar o seu site