jef.works

Sivuston tiedot jef.works

JEFworks Lab - Welcome to the JEFworks Lab

 Luotu Toukokuu 02 2026 01:05 AM

Vanhentuneet tiedot? PÄIVITÄ !

Pisteet 63/100

SEO Sisältö

Otsikko

JEFworks Lab - Welcome to the JEFworks Lab

Pituus : 42

Täydellistä, otsikkosi sisältää väliltä 10 ja 70 kirjainta.

Kuvaus

Lab website of Prof. Jean Fan and team work at Johns Hopkins University

Pituus : 71

Hienoa, sinun meta-kuvauksesi sisältää väliltä70 ja 160 kirjainta.

Avainsanat

bioinformatics, single cell, spatial transcriptomics, spatially resolved transcriptomics, merfish, computational biology, research lab, JHU research opportunities

Hyvä, sinun sivullasi on meta -avainsanoja.

Open Graph (OG-tägit) tarjoavat mahdollisuuden merkitä verkkosivustojen sisältöä meta-tiedoilla.

Hienoa, sinun sivu käyttää hyödyksi Open Graph protokollaa (OG meta prop).

Omaisuus Sisältö
title Welcome to the JEFworks Lab
locale en_US
description Lab website of Prof. Jean Fan and team work at Johns Hopkins University
url http://jefworks-lab.github.io//
site_name JEFworks Lab
image http://jefworks-lab.github.io//assets/banners/bg.jpg
type website

Otsikot

H1 H2 H3 H4 H5 H6
4 7 1 0 0 0
  • [H1] Welcome to the JEFworks Lab, where Prof. Jean Fan and team work on statistical analysis approaches and machine learning tools for analyzing big spatially resolved omics data to better understand the molecular and spatial-contextual factors shaping cellular identity and heterogeneity in the context of human health and disease.
  • [H1]
  • [H1]
  • [H1]
  • [H2] We are a bioinformatics research lab in the Center for Computational Biology and the Department of Biomedical Engineering at Johns Hopkins University. Meet our team!
  • [H2] We develop bioinformatics methods for analyzing spatially resolved sequencing and imaging data.
  • [H2] We apply these bioinformatics methods to better understand the role of cellular heterogeneity in disease.
  • [H2] Latest Publications
  • [H2] Latest News
  • [H2] Latest Blog Posts
  • [H2] Latest Lab Fun
  • [H3] Follow us on social media for the latest updates on our blog posts, code tutorials, software tools, and more!

Kuvat

Emme löytäneet 39 yhtään kuvia tältä sivustolta.

22 Alt-attribuutit on tyhjiä tai poistettu. Lisää vaihtoehtoista tekstiä niin, että hakukoneet ymmärtävät paremmin kuvatesi sisällön.

Kirjain/HTML suhde

Suhde : 35%

Hipoo täydellisyyttä! Tämä sivu /sivut sisältää tekstiä suhteesssa HTML-koodiin on suurempi kuin 15, mutta kuitenkin alle 25 prosenttia.

Flash

Täydellistä!, Flash-sisältöä ei ole havaittu tällä sivulla.

html-dokumentti sivun sisälle (Iframe)

Hienoa, Tällä sivulla ei ole Iframeja.

URL- Uudelleenkirjoitus

Hyvä. Sinun linkkisi näyttävät puhtailta!

Alleviivaa URL-osoitteet

Olemme havainneet merkintöjä URL-osoitteissasi. Sinun pitäisi pikemminkin käyttää väliviivoja optimoimaan SEO.

Sivun linkit

Löysimme yhteensä 33 linkit jotka sisältää 0 linkit tiedostoihin

Ankkuri Tyyppi Mehu
Our Mission Sisäinen Antaa mehua
Meet the Team Sisäinen Antaa mehua
Lab Resources Sisäinen Antaa mehua
Publications Sisäinen Antaa mehua
Software Sisäinen Antaa mehua
Courses Sisäinen Antaa mehua
Talks Sisäinen Antaa mehua
Join Sisäinen Antaa mehua
Contact Sisäinen Antaa mehua
Blog Sisäinen Antaa mehua
Center for Computational Biology Ulkoinen Antaa mehua
Department of Biomedical Engineering Ulkoinen Antaa mehua
Meet our team! Sisäinen Antaa mehua
Gohta Aihara, Kalen Clifton, Mayling Chen, Zhuoyan Li, Lyla Atta, Brendan F Miller, Rahul Satija, John W Hickey, Jean Fan^. SEraster - a rasterization preprocessing framework for scalable spatial omics data analysis. Bioinformatics. June 20, 2024. doi.org/10.1093/bioinformatics/btae412 Sisäinen Antaa mehua
Lyla Atta, Kalen Clifton, Manjari Anant, Gohta Aihara, and Jean Fan^. Gene count normalization in single-cell imaging-based spatially resolved transcriptomics. Genome Biology. June 12, 2024. doi.org/10.1186/s13059-024-03303-w Sisäinen Antaa mehua
Kalen Clifton*, Manjari Anant*, Gohta Aihara, Lyla Atta, Osagie K Aimiuwu, Justus M Kebschull, Michael I Miller, Daniel Tward^, Jean Fan^. STalign - alignment of spatial transcriptomics data using diffeomorphic metric mapping. Nature Communications. December 8, 2023. doi.org/10.1038/s41467-023-43915-7 Sisäinen Antaa mehua
Brendan F Miller, Feiyang Huang, Lyla Atta, Arpan Sahoo, Jean Fan^. Reference-free cell type deconvolution of pixel-resolution spatially resolved transcriptomics data. Nature Communications. 2022. doi:/10.1038/s41467-022-30033-z Sisäinen Antaa mehua
Lyla Atta, Jean Fan^. Computational challenges and opportunities in spatially resolved transcriptomic data analysis. Nature Communications. 2021. doi:10.1038/s41467-021-25557-9 Sisäinen Antaa mehua
Spatial Transcriptomics As Rasterized Image Tensors (STARIT) characterizes cell states with subcellular molecular heterogeneity Sisäinen Antaa mehua
STcompare - comparative spatial transcriptomics data analysis of structurally matched tissues to characterize differentially spatially patterned genes Sisäinen Antaa mehua
Impact of Data Quality on Deep Learning Prediction of Spatial Transcriptomics from Histology Images Sisäinen Antaa mehua
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes Sisäinen Antaa mehua
Evidence of off-target probe binding in the 10x Genomics Xenium v1 Human Breast Gene Expression Panel compromises accuracy of spatial transcriptomic profiling Sisäinen Antaa mehua
Prof. Fan teaches first year BME PhD students about the limitations of summary statistics and the importance of visualizing your data! Sisäinen Antaa mehua
Dr. Fan and Caleb give invited talks at the Broad Institute Models, Inference, and Algorithms seminar series. Sisäinen Antaa mehua
Prof. Fan teaches Genomic Data Visualization again this semester! JEFworks Lab members give guest lectures in the Genomic Data Visualizations class. Sisäinen Antaa mehua
Vivien and Kalen presents their work at the WSE/DOM retreat. Thanks to Liz and Rafael for the photos. Sisäinen Antaa mehua
Dr. Fan gives an invited talk at the Center for Bioinformatics and Quantitative Biology at University of Illinois at Chicago. Sisäinen Antaa mehua
Vibe coding with SEraster and STcompare to compare spatial transcriptomics technologies Sisäinen Antaa mehua
RNA velocity in situ infers gene expression dynamics using spatial transcriptomics data Sisäinen Antaa mehua
Analyzing ICE Arrest Data - Part 2 Sisäinen Antaa mehua
Analyzing ICE Detention Data from 2021 to 2025 Sisäinen Antaa mehua
Creative Commons Attribution 4.0 International License Ulkoinen Antaa mehua

SEO avainsanat

Avainsana pilvi

analysis bioinformatics spatial transcriptomics jean heterogeneity fan lab data spatially

Avainsanojen johdonmukaisuus

Avainsana Sisältö Otsikko Avainsanat Kuvaus Otsikot
fan 15
data 14
spatial 12
jean 10
transcriptomics 9

Käytettävyys

Url

Sivusto : jef.works

Pituus : 9

Pikkukuva (favicon)

Hienoa, sinun sivulla on favicon (pikakuvake).

Tulostettavuus

Emme löytäneet tulostusystävällistä CSS-palvelua.

Kieli

Et ole määrittänyt kieltä. Käytä tätä ilmaista meta tägi generaattoria määrittääksesi sivustosi kielen.

Metatietosanastostandardi informaatio (DC)

Tämä sivu ei käytä hyödyksi (DublinCore =DC) metatietosanastostandardi informaatiokuvausta.

Dokumentti

(dokumenttityyppi); Merkistökoodaus

HTML 5

Koodaus/tietojenkäsittely

Täydellistä. Ilmoitettu asiakirjan merkkijono on UTF-8.

W3C Voimassaolo

Virheet : 0

Varoitukset : 0

Sähköpostin yksityisyys

Mahtavaa!sähköpostiosoitteita ei ole löytynyt tavallisesta tekstistä!

HTML Epäonnistui

Tägit Epäonnistui Esiintymät
<u> 3

Epäillyt HTML-koodit ovat HTML-tageja, joita ei enää käytetä. On suositeltavaa poistaa tai korvata nämä HTML-tunnisteet, koska ne ovat vanhentuneet.

Nopeus neuvot

Erinomaista, verkkosivustosi ei käytä sisäkkäisiä taulukoita.
Harmillista, Sivustosi käyttää sisäisiä tyylejä.
Hienoa, Sivustossasi on muutamia CSS-tiedostoja.
Perfect, sivustossasi on muutamia JavaScript-tiedostoja.
Täydellistä, Sivustosi hyödyntää gzipia.

Mobiili

Mobiili optimointi

Apple-kuvake
Meta Viewport -tunniste
Flash sisältö

Optimoi

XML Sivukartta

Hienoa, sivustossasi on XML-sivukartta.

http://jefworks-lab.github.io//sitemap.xml

Robots.txt

https://jef.works/robots.txt

Hienoa, sivustossasi on robots.txt-tiedosto.

Analyysit

Hienoa, sivustossasi on analyysityökalu.

   Google Analytics

Sivuston nopeus

Laite
Luokat

Free SEO Testing Tool

Free SEO Testing Tool On ilmainen SEO työkalu, joka auttaa sinua analysoimaan Web-sivusi