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Pathway Commons: A Resource for Biological Pathway Analysis

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Pathway Commons: A Resource for Biological Pathway Analysis

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Anchor Type Juice
public pathway and interactions databases Interno Passing Juice
here Interno Passing Juice
Pathway Commons 2019 Update. Nucleic Acids Res (2019) Externo Passing Juice
Author-sourced pathway capture using Biofactoid. eLife (2021) Externo Passing Juice
Example: 'TP53' interactors Interno Passing Juice
Example: 'Transcriptional activation of cell cycle inhibitor p21' (Reactome) Interno Passing Juice
BioPAX Externo Passing Juice
software that we provide Externo Passing Juice
gene set database file downloads Interno Passing Juice
Gene Set Enrichement Analysis (GSEA) Externo Passing Juice
Details about the BioPAX format Externo Passing Juice
Search and view Interno Passing Juice
Chisio BioPAX Editor (ChiBE) Externo Passing Juice
Cytoscape Externo Passing Juice
R programming language Externo Passing Juice
web services Interno Passing Juice
SPARQL endpoint Interno Passing Juice
Biological Pathway Exchange (BioPAX) Externo Passing Juice
BioPAX validator Externo Passing Juice
PaxTools Externo Passing Juice
Pathway Commons help Externo Passing Juice
Pathway Commons announcements Externo Passing Juice
Bader Lab Externo Passing Juice
University of Toronto Externo Passing Juice
Sander Lab Externo Passing Juice
Dana-Farber Cancer Institute Externo Passing Juice
Harvard Medical School Externo Passing Juice
Oregon Health & Science University Externo Passing Juice
Top Interno Passing Juice

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services biopax commons analysis pathway web access from data cytoscape

Consistenza Keywords

Keyword Contenuto Title Keywords Description Headings
pathway 20
biopax 12
commons 10
data 8
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